Я использую панд для записи в файл Excel следующим образом:
import pandas
writer = pandas.ExcelWriter('Masterfile.xlsx')
data_filtered.to_excel(writer, "Main", cols=['Diff1', 'Diff2'])
writer.save()
Masterfile.xlsx уже состоит из множества разных вкладок. Тем не менее, он еще не содержит "Main".
Pandas правильно пишет на "основной" лист, к сожалению, он также удаляет все остальные вкладки.