Как исключить папку node_modules из Atom ищет "Найти в проекте" после того, как вы установили node_modules внутри вашего файла.gitignore? Требует ли атом, чтобы на самом деле проект имел репозиторий git, или должен ли иметь.gitignore для Atom, чтобы исключить эту папку?
Мой.gitignore выглядит так:
.DS_STORE
*.log
node_modules
dist
coverage