Может ли dplyr суммировать несколько переменных без перечисления каждого из них?

dplyr удивительно быстрый, но мне интересно, не хватает ли я чего-то: возможно ли это обобщение по нескольким переменным. Например:

library(dplyr)
library(reshape2)

(df=dput(structure(list(sex = structure(c(1L, 1L, 2L, 2L), .Label = c("boy", 
"girl"), class = "factor"), age = c(52L, 58L, 40L, 62L), bmi = c(25L, 
23L, 30L, 26L), chol = c(187L, 220L, 190L, 204L)), .Names = c("sex", 
"age", "bmi", "chol"), row.names = c(NA, -4L), class = "data.frame")))

   sex age bmi chol
1  boy  52  25  187
2  boy  58  23  220
3 girl  40  30  190
4 girl  62  26  204

dg=group_by(df,sex)

С помощью этого небольшого блока данных легко написать

summarise(dg,mean(age),mean(bmi),mean(chol))

И я знаю, что, чтобы получить то, что хочу, я мог расплавиться, получить средства, а затем dcast, например

dm=melt(df, id.var='sex')
dmg=group_by(dm, sex, variable); 
x=summarise(dmg, means=mean(value))
dcast(x, sex~variable)

Но что, если у меня есть > 20 переменных и очень большое количество строк. Есть ли что-то похожее на .SD в data.table, что позволило бы мне использовать средства всех переменных в сгруппированном кадре данных? Или, возможно ли как-то использовать привязку к сгруппированному кадру данных?

Спасибо за любую помощь

Ответ 1

Идиома data.table lapply(.SD, mean), которая

DT <- data.table(df)
DT[, lapply(.SD, mean), by = sex]
#     sex age bmi  chol
# 1:  boy  55  24 203.5
# 2: girl  51  28 197.0

Я не уверен в идиоме dplyr для того же, но вы можете сделать что-то вроде

dg <- group_by(df, sex)
# the names of the columns you want to summarize
cols <- names(dg)[-1]
# the dots component of your call to summarise
dots <- sapply(cols ,function(x) substitute(mean(x), list(x=as.name(x))))
do.call(summarise, c(list(.data=dg), dots))
# Source: local data frame [2 x 4]

#    sex age bmi  chol
# 1  boy  55  24 203.5
# 2 girl  51  28 197.0

Обратите внимание, что существует проблема github # 178 для эффективного внедрения plyr idiom colwise в dplyr.

Ответ 1

Ответ 2