Loop_apply.o: файл не распознан: формат файла не распознан

Я пытаюсь установить пакет R s plyr. Вот сообщение об ошибке:

* installing *source* package ‘plyr’ ...
** package ‘plyr’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** libs
clang++  -I/opt/R-3.4.1/include -DNDEBUG  -I"/home/isomorphismes/R/i686-pc-linux-gnu-library/3.4/Rcpp/include" -I/usr/local/include   -fpic  -I/opt/boost_1_61_0/boost -c RcppExports.cpp -o RcppExports.o
clang -I/opt/R-3.4.1/include -DNDEBUG  -I"/home/cd/R/i686-pc-linux-gnu-library/3.4/Rcpp/include" -I/usr/local/include   -fpic  -g -O2 -flto -c loop_apply.c -o loop_apply.o
clang++  -I/opt/R-3.4.1/include -DNDEBUG  -I"/home/isomorphismes/R/i686-pc-linux-gnu-library/3.4/Rcpp/include" -I/usr/local/include   -fpic  -I/opt/boost_1_61_0/boost -c split-numeric.cpp -o split-numeric.o
clang++ -shared -L/usr/local/lib -o plyr.so RcppExports.o loop_apply.o split-numeric.o
loop_apply.o: file not recognized: File format not recognized
clang: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation)
/opt/R-3.4.1/share/make/shlib.mk:6: recipe for target 'plyr.so' failed
make: *** [plyr.so] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘plyr’
* removing ‘/home/cd/R/i686-pc-linux-gnu-library/3.4/plyr’

Файлы *.o находятся в /opt/plyr/src, from github.com/hadley/plyr. Они выглядят как в моей системе:

[email protected]:/opt/plyr/src$ file *o
loop_apply.o:    LLVM IR bitcode
RcppExports.o:   ELF 32-bit LSB relocatable, Intel 80386, version 1 (SYSV), not stripped
split-numeric.o: ELF 32-bit LSB relocatable, Intel 80386, version 1 (SYSV), not stripped

Ответ 1

В случае, если вы не знаете, -flto указывает оптимизацию времени ссылки и был добавлен Р. Как вам удалось закончить с такой неправильно настроенной установкой R?

Добавление команды -flto в ссылку может работать? Или удалите его из строки компиляции loop_apply. Если любой из этих работ работает, вам необходимо исправить вашу R-установку.