Вычисление матричного продукта намного медленнее с SSE, чем с прямым алгоритмом

Я хочу умножить две матрицы, один раз, используя алгоритм прямой прямой связи:

template <typename T>
void multiplicate_straight(T ** A, T ** B, T ** C, int sizeX)
{
    T ** D = AllocateDynamicArray2D<T>(sizeX, sizeX);
    transpose_matrix(B, D,sizeX);
    for(int i = 0; i < sizeX; i++)
    {
        for(int j = 0; j < sizeX; j++)
        {
            for(int g = 0; g < sizeX; g++)
            {
                C[i][j] += A[i][g]*D[j][g];
            }
        }
    }
    FreeDynamicArray2D<T>(D);
}

и один раз с помощью SSE-функций. Для этого я создал две функции:

template <typename T>
void SSE_vectormult(T * A, T * B, int size)
{

    __m128d a;
    __m128d b;
    __m128d c;
#ifdef linux
    double A2[2], B2[2], C[2] __attribute__ ((aligned(16)));
#endif
#ifdef _WIN32
    __declspec(align(16)) double A2[2], B2[2], C[2];
#endif
    for(int i = 0; i < size; i+=2)
    {
        //std::cout << "In SSE_vectormult: i is: " << i << '\n';
        A2[0] = A[i];
        B2[0] = B[i];
        A2[1] = A[i+1];
        B2[1] = B[i+1];
        //std::cout << "Values from A and B written to A2 and B2\n";
        a = _mm_load_pd(A2);
        b = _mm_load_pd(B2);
        //std::cout << "Values converted to a and b\n";
        c = _mm_mul_pd(a,b);
        _mm_store_pd(C, c);
        A[i] = C[0];
        A[i+1] = C[1];
    };
}

и

template <typename T>
void multiplicate_SSE(T ** A, T ** B, T ** C, int sizeX)
{
//    std::cout << "Entered SSE-Function\n";
    T ** D = AllocateDynamicArray2D<T>(sizeX, sizeX);
    T * tmp = AllocateDynamicArray1D<T>(sizeX);
    T * tmp2 = AllocateDynamicArray1D<T>(sizeX);
    //std::cout << "Matrices allocated\n";
    transpose_matrix<T>(B, D,sizeX);
    //std::cout << "Matrix B transposed\n";
    for(int i = 0; i < sizeX; i++)
    {
        for(int j = 0; j < sizeX; j++)
        {
            extract_row<T>(A,tmp, i, sizeX);
//            std::cout << "Row from A extracted\n";
            //print_vector(tmp, sizeX);
            extract_row<T>(D, tmp2, j, sizeX);
//            std::cout << "Row from D extracted\n";
            //print_vector(tmp2, sizeX);
            SSE_vectormult<T>(tmp, tmp2, sizeX);
//            std::cout << "Vectors multiplicated\n";
            //print_vector(tmp, sizeX);
            C[i][j] = add_vector(tmp, sizeX);
//            std::cout << "Written value to C\n";
//            std::cout << "j is " << j << " and i is " << i << '\n';
        }
    }
//    std::cout << "Loop finished\n";
    FreeDynamicArray2D<T>(D);
    //std::cout << "Freed D\n";
    //FreeDynamicArray1D<T>(tmp);????
//    std::cout << "Freed tmp\n";
    FreeDynamicArray1D<T>(tmp2);
//    std::cout << "Everything freed, returning\n";
}

Но потом у меня возникает несколько проблем: с одной стороны, когда я хочу освободить tmp-массив в multipicate_SSE(), помеченном несколькими вопросительными знаками, я получаю сообщение об ошибке "_BLOCK_TYPE_IS_VALID". Я подумал о возможности освобождения одного и того же пространства дважды, поэтому я раскоментировал это (но, как я полагаю, я получаю утечку памяти через это?). Теперь, когда я сравниваю производительность обеих функций с одинаковыми матрицами, функция SSE нуждается примерно в четыре раза дольше для двух матриц 1024x1024, чем метод прямой перемотки. Как я могу переписать мою SSE-функцию, чтобы получить лучшую производительность (раньше я никогда не работал с SSE), и как я могу исправить утечку памяти?
Спасибо!

Ответ 1

У вас есть правильная идея, взяв транспонирование в скалярном коде, но вы не хотите точно транспонировать при использовании SSE.

Пусть придерживается float (SGEMM). То, что вы хотите сделать с SSE, - это сделать сразу четыре точечных продукта. Вы хотите C = A*B. Посмотрим на матрицу 8x8. Предположим, что B:

(0   1  2  3) ( 4  5  6  7)
(8   9 10 11) (12 13 14 15) 
(16 17 18 19) (20 21 22 23)
(24 25 26 27) (28 29 30 31)
(32 33 34 35) (36 37 38 39)
(40 41 42 43) (44 45 46 47)
(48 49 50 51) (52 53 54 55)
(56 57 58 59) (60 61 62 63)

Итак, с помощью SSE:

C[0][0] C[0][1] C[0][2] C[0][3] = 
A[0][0]*(0 1 2 3) + A[0][1]*(8 9 10 11) + A[0][2]*(16 17 18 19)...+ A[0][7]*(56 57 58 59)

Это дает вам четыре точечных продукта сразу. Проблема в том, что вам нужно перемещаться по столбцу в B, а значения не находятся в одной строке кэша. Было бы лучше, если бы каждый столбец ширины четыре был смежным в памяти. Поэтому вместо переноса транспонирования каждого элемента вы переносите полосы шириной 4 следующим образом:

(0  1  2  3)( 8  9 10 11)(16 17 18 19)(24 25 26 27)(32 33 34 35)(40 41 42 43)(48 49 50 51)(56 57 58 59)
(4  5  6  7)(12 13 14 15)(20 21 22 23)(28 29 30 31)(36 37 38 39)(44 45 46 47)(52 53 54 55)(60 61 62 63)

Если вы считаете, что каждое из четырех значений в круглых скобках равно единице, это эквивалентно переносу матрицы 8x2 в матрицу 2x8. Обратите внимание, что столбцы ширины четыре из B являются непрерывный в памяти. Это гораздо больше кэш-памяти. Для матрицы 8x8 это не проблема, но, например, с матрицей 1024x1024. См. Код ниже, как это сделать. Для AVX вы переносите полосы шириной 8 (что означает, что вам нечего делать для матрицы 8x8). Для двойной ширины два с SSE и четыре с AVX.

Это должно быть в четыре раза быстрее, чем скалярный код, предполагающий, что матрицы вписываются в кеш. Однако для больших матриц этот метод по-прежнему будет привязан к памяти, поэтому ваш код SSE может быть не намного быстрее, чем скалярный код (но это не должно быть хуже).

Однако, если вы используете черепицу цикла и переставляете матрицу в виде плиток (которые вписываются в кеш L2), а не для всего матричного умножения матрицы, это вычисление связано, а не связано с памятью даже для очень больших матриц, t в кеш-памяти L3. Этот другой вопрос.

Изменить: некоторый (непроверенный) код для сравнения с вашим скалярным кодом. Я развернул цикл на 2.

void SGEMM_SSE(const float *A, const float *B, float *C, const int sizeX) {
    const int simd_width = 4;
    const int unroll = 2;
    const int strip_width = simd_width*unroll
    float *D = (float*)_mm_malloc(sizeof(float)*sizeX*sizeX, 16);
    transpose_matrix_strip(B, D,sizeX, strip_width); //tranpose B in strips of width eight
    for(int i = 0; i < sizeX; i++) {
        for(int j = 0; j < sizeX; j+=strip_width) {
            float4 out_v1 = 0; //broadcast (0,0,0,0)
            float4 out_V2 = 0;
            //now calculate eight dot products
            for(int g = 0; g < sizeX; g++) {
                //load eight values rrom D into two SSE registers
                float4 vec4_1.load(&D[j*sizeX + strip_width*g]);
                float4 vec4_2.load(&D[j*sizeX + strip_width*g + simd_width]);
                out_v1 += A[i][g]*vec4_v1;
                out_v2 += A[i][g]*vec4_v2;
            }
            //store eight dot prodcuts into C
            out_v1.store(&C[i*sizeX + j]);
            out_v2.store(&C[i*sizeX + j + simd_width]);
        }
    }
    _mm_free(D);
}

void transpose_matrix_strip(const float* A, float* B, const int N, const int strip_width) {
    //#pragma omp parallel for
    for(int n=0; n<N*N; n++) {
        int k = strip_width*(n/N/strip_width);
        int i = (n/strip_width)%N;
        int j = n%strip_width;
        B[n] = A[N*i + k + j];
    }
}

Обратите внимание, что j теперь увеличивается на восемь. Больше разворачивания может помочь. Если вы хотите использовать intrinsics, вы можете использовать _mm_load_ps, _mm_store_ps, _mm_set1_ps (для трансляций, например _mm_set1_ps(A[i][g])), _mm_add_ps и _mm_mul_ps. Что это.

Ответ 2

Я считаю, что это должно делать то же самое, что и первый цикл с SSE, предполагая, что sizeX является кратным двум, а память выравнивается по 16 байт.

Вы можете получить немного большую производительность, разворачивая цикл и используя несколько временных переменных, которые вы добавляете вместе в конце. Вы также можете попробовать AVX и новую команду Fused Multiply Add.

template <typename T>
void multiplicate_SSE2(T ** A, T ** B, T ** C, int sizeX)
{
    T ** D = AllocateDynamicArray2D<T>(sizeX, sizeX);
    transpose_matrix(B, D,sizeX);
    for(int i = 0; i < sizeX; i++)
    {
        for(int j = 0; j < sizeX; j++)
        {
            __m128d temp = _mm_setzero_pd();
            for(int g = 0; g < sizeX; g += 2)
            {
                __m128d a = _mm_load_pd(&A[i][g]);
                __m128d b = _mm_load_pd(&D[j][g]);
                temp = _mm_add_pd(temp, _mm_mul_pd(a,b));
            }
            // Add top and bottom half of temp together
            temp = _mm_add_pd(temp, _mm_shuffle_pd(temp, temp, 1));
            _mm_store_sd(temp, &C[i][j]); // Store one value
        }
    }
    FreeDynamicArray2D<T>(D);
}