Пул приложений продолжал останавливаться при каждом запуске и выдавал эту ошибку в журналах приложений:
Рабочий процесс для пула приложений "APP_POOL_NAME" обнаружил ошибку "Не удается прочитать файл конфигурации" при попытке чтения данных конфигурации из файла "\\?\<EMPTY>", номер строки "0". Поле данных содержит код ошибки.
Несколько пользователей отметили, что это происходит после Windows 10 Fall Update.