То, что вы пытаетесь сделать, не будет работать, поскольку Thymeleaf обрабатывает шаблон на стороне сервера, и поэтому переменные, к которым он имеет доступ, являются теми, которые определены в нем.
Если у вас была myVariable в модели, на которой работает Thymeleaf, это сработает.
Если вы хотите установить значение переменной Javascript в шаблоне Thymeleaf, вы можете сделать следующее: