Извлечь данные из ggplot

Я сделал график, используя ggplot2 geom_histogram из фрейма данных. См. Пример ниже и ссылку на гистограмму ggplot. Необходимо пометить каждый geom_vline с помощью факторов, используя вложенную функцию ddply и перенос по фасету.

Теперь мне нужно создать фрейм данных, который содержит обобщенные данные, использованные для генерации ggplot выше.

Sector2 Family  Year    Length
BUN Acroporidae 2010    332.1300496
BUN Poritidae   2011    141.1467966
BUN Acroporidae 2012    127.479
BUN Acroporidae 2013    142.5940556
MUR Faviidae    2010    304.0405
MUR Faviidae    2011    423.152
MUR Pocilloporidae  2012    576.0295
MUR Poritidae   2013    123.8936667
NTH Faviidae    2010    60.494
NTH Faviidae    2011    27.427
NTH Pocilloporidae  2012    270.475
NTH Poritidae   2013    363.4635

ОТВЕТЫ

Ответ 1

Чтобы получить фактические значения значений, вы можете использовать функцию ggplot_build(), где аргументом является ваш график.

p <- ggplot(mtcars,aes(mpg))+geom_histogram()+
      facet_wrap(~cyl)+geom_vline(data=data.frame(x=c(20,30)),aes(xintercept=x))

pg <- ggplot_build(p)

Это сделает список, а один из подписок - data. Этот подсписок содержит фреймворк со значениями, используемыми в графике, например, для histrogramm он содержит значения y (то же, что и count). Если вы используете грани, то столбец PANEL показывает, в каких значениях используются грани. Если на вашем участке больше одного geom_, тогда данные будут содержать данные для каждого из них - в моем примере есть один фрейм данных для гистограммы, а другой для vlines.

head(pg$data[[1]])
  y count         x ndensity ncount density PANEL group ymin ymax
1 0     0  9.791667        0      0       0     1     1    0    0
2 0     0 10.575000        0      0       0     1     1    0    0
3 0     0 11.358333        0      0       0     1     1    0    0
4 0     0 12.141667        0      0       0     1     1    0    0
5 0     0 12.925000        0      0       0     1     1    0    0
6 0     0 13.708333        0      0       0     1     1    0    0
      xmin     xmax
1  9.40000 10.18333
2 10.18333 10.96667
3 10.96667 11.75000
4 11.75000 12.53333
5 12.53333 13.31667
6 13.31667 14.10000

head(pg$data[[2]])
  xintercept PANEL group xend  x
1         20     1     1   20 20
2         30     1     1   30 30
3         20     2     2   20 20
4         30     2     2   30 30
5         20     3     3   20 20
6         30     3     3   30 30

Ответ 2

Если вам нужны только данные, кажется, что layer_data предназначена именно для этого:

layer_data(p, 1)

Он выдаст вам данные первого слоя, такие же как ggplot_build(p)$data[[1]].

Его исходный код действительно является function (plot, я = 1L) ggplot_build(plot)$data[[i]]

Ответ 3

В то время как другие ответы приближают вас, если вы ищете фактические данные, которые были переданы в ggplot(), вы можете использовать:

ggplot_build(p)$plot$data

require(tidyverse)

p <- ggplot(mtcars,aes(mpg))+geom_histogram()+
  facet_wrap(~cyl)+geom_vline(data=data.frame(x=c(20,30)),aes(xintercept=x))

pg <- ggplot_build(p)
#> 'stat_bin()' using 'bins = 30'. Pick better value with 'binwidth'.

pg$plot$data
#>                      mpg cyl  disp  hp drat    wt  qsec vs am gear carb
#> Mazda RX4           21.0   6 160.0 110 3.90 2.620 16.46  0  1    4    4
#> Mazda RX4 Wag       21.0   6 160.0 110 3.90 2.875 17.02  0  1    4    4
#> Datsun 710          22.8   4 108.0  93 3.85 2.320 18.61  1  1    4    1
#> Hornet 4 Drive      21.4   6 258.0 110 3.08 3.215 19.44  1  0    3    1
#> Hornet Sportabout   18.7   8 360.0 175 3.15 3.440 17.02  0  0    3    2
#> Valiant             18.1   6 225.0 105 2.76 3.460 20.22  1  0    3    1
#> Duster 360          14.3   8 360.0 245 3.21 3.570 15.84  0  0    3    4
#> Merc 240D           24.4   4 146.7  62 3.69 3.190 20.00  1  0    4    2
#> Merc 230            22.8   4 140.8  95 3.92 3.150 22.90  1  0    4    2
#> Merc 280            19.2   6 167.6 123 3.92 3.440 18.30  1  0    4    4
#> Merc 280C           17.8   6 167.6 123 3.92 3.440 18.90  1  0    4    4
#> Merc 450SE          16.4   8 275.8 180 3.07 4.070 17.40  0  0    3    3
#> Merc 450SL          17.3   8 275.8 180 3.07 3.730 17.60  0  0    3    3
#> Merc 450SLC         15.2   8 275.8 180 3.07 3.780 18.00  0  0    3    3
#> Cadillac Fleetwood  10.4   8 472.0 205 2.93 5.250 17.98  0  0    3    4
#> Lincoln Continental 10.4   8 460.0 215 3.00 5.424 17.82  0  0    3    4
#> Chrysler Imperial   14.7   8 440.0 230 3.23 5.345 17.42  0  0    3    4
#> Fiat 128            32.4   4  78.7  66 4.08 2.200 19.47  1  1    4    1
#> Honda Civic         30.4   4  75.7  52 4.93 1.615 18.52  1  1    4    2
#> Toyota Corolla      33.9   4  71.1  65 4.22 1.835 19.90  1  1    4    1
#> Toyota Corona       21.5   4 120.1  97 3.70 2.465 20.01  1  0    3    1
#> Dodge Challenger    15.5   8 318.0 150 2.76 3.520 16.87  0  0    3    2
#> AMC Javelin         15.2   8 304.0 150 3.15 3.435 17.30  0  0    3    2
#> Camaro Z28          13.3   8 350.0 245 3.73 3.840 15.41  0  0    3    4
#> Pontiac Firebird    19.2   8 400.0 175 3.08 3.845 17.05  0  0    3    2
#> Fiat X1-9           27.3   4  79.0  66 4.08 1.935 18.90  1  1    4    1
#> Porsche 914-2       26.0   4 120.3  91 4.43 2.140 16.70  0  1    5    2
#> Lotus Europa        30.4   4  95.1 113 3.77 1.513 16.90  1  1    5    2
#> Ford Pantera L      15.8   8 351.0 264 4.22 3.170 14.50  0  1    5    4
#> Ferrari Dino        19.7   6 145.0 175 3.62 2.770 15.50  0  1    5    6
#> Maserati Bora       15.0   8 301.0 335 3.54 3.570 14.60  0  1    5    8
#> Volvo 142E          21.4   4 121.0 109 4.11 2.780 18.60  1  1    4    2

Создано 2019-03-04 пакетом представлением (v0.2.1)

Хотя это не полезно для неизмененного фрейма данных, если вы просматриваете серию mutate() или Sumumize summarize() до того, как попадаете на ggplot, это может быть полезно после того, как будут показаны данные.