Этот код использовался, начиная с 1 мая 2017 года (dplyr версия 0.5.0). При dplyr версии 0.7 он терпит неудачу с Error: Variable context not set. Я не мог найти решение googling или посмотреть в dplyr NEWS file.
Эта часть в порядке (настройка примера - возможно, будет упрощена...)
xx <- data.frame(stud_number=1:3,HW1=rep(0,3),HW2=c(NA,1,1),junk=rep(NA,3))
repl_1_NA <- function(x) { return(replace(x,which(x==1),NA)) }
hw1 <- xx %>% select(c(stud_number,starts_with("HW")))
Теперь попробуйте использовать mutate_at(): сбой с dplyr version >= 0.7.0
hw1 %>% mutate_at(starts_with("HW"),repl_1_NA)