Получение пути к R script

Есть ли способ программно найти путь к R script внутри самого script?

Я спрашиваю об этом, потому что у меня есть несколько сценариев, которые используют RGtk2 и загружают графический интерфейс из файла .glade.

В этих сценариях я обязан поместить инструкцию setwd("path/to/the/script") в начале, иначе файл .glade(который находится в том же каталоге) не будет найден.

Это нормально, но если я перемещаю script в другой каталог или на другой компьютер, мне нужно изменить путь. Я знаю, это неважно, но было бы неплохо иметь что-то вроде:

setwd(getScriptPath())

Итак, существует ли подобная функция?

Ответ 1

Используйте source("yourfile.R", chdir = T)

Ответ 2

Это работает для меня:

getSrcDirectory(function(x) {x})

Это определяет анонимную функцию (которая ничего не делает) внутри script, а затем определяет исходный каталог этой функции, который является каталогом, в котором находится script.

Ответ 3

Только для RStudio:

setwd(dirname(rstudioapi::getActiveDocumentContext()$path))

Это работает при запуске или источнике файла.

Ответ 4

Использовать неявный аргумент "-file" для Rscript

При вызове script с использованием "Rscript" (

Ответ 5

Если вы завершаете свой код в пакете, вы всегда можете запрашивать части каталога пакетов.
Вот пример из пакета RGtk2:

> system.file("ui", "demo.ui", package="RGtk2")
[1] "C:/opt/R/library/RGtk2/ui/demo.ui"
>

Вы можете сделать то же самое с каталогом inst/glade/ в ваших источниках, который станет каталогом glade/ в установленном пакете - и system.file() будет вычислять путь для вас при установке, независимо от ОС.

Ответ 6

Этот ответ отлично работает для меня:

script.dir <- dirname(sys.frame(1)$ofile)

Примечание: script должен быть отправлен для возврата правильного пути

Я нашел его в: https://support.rstudio.com/hc/communities/public/questions/200895567-can-user-obtain-the-path-of-current-Project-s-directory-

Но я до сих пор не понимаю, что такое sys.frame(1) $$. Я ничего не нашел об этом в документации R. Кто-нибудь может это объяснить?

Ответ 7

#' current script dir
#' @param
#' @return
#' @examples
#' works with source() or in RStudio Run selection
#' @export
z.csd <- function() {
    # http://stackoverflow.com/questions/1815606/rscript-determine-path-of-the-executing-script
    # must work with source()
    if (!is.null(res <- .thisfile_source())) res
    else if (!is.null(res <- .thisfile_rscript())) dirname(res)
    # http://stackoverflow.com/a/35842176/2292993  
    # RStudio only, can work without source()
    else dirname(rstudioapi::getActiveDocumentContext()$path)
}
# Helper functions
.thisfile_source <- function() {
    for (i in -(1:sys.nframe())) {
        if (identical(sys.function(i), base::source))
            return (normalizePath(sys.frame(i)$ofile))
    }

    NULL
}
.thisfile_rscript <- function() {
    cmdArgs <- commandArgs(trailingOnly = FALSE)
    cmdArgsTrailing <- commandArgs(trailingOnly = TRUE)
    cmdArgs <- cmdArgs[seq.int(from=1, length.out=length(cmdArgs) - length(cmdArgsTrailing))]
    res <- gsub("^(?:--file=(.*)|.*)$", "\\1", cmdArgs)

    # If multiple --file arguments are given, R uses the last one
    res <- tail(res[res != ""], 1)
    if (length(res) > 0)
        return (res)

    NULL
}

Ответ 8

Как насчет использования команд системы и оболочки? С окнами один, я думаю, когда вы открываете script в RStudio, он устанавливает текущий каталог оболочки в каталог script. Возможно, вам придется добавить cd C:\e.g или любой диск, который вы хотите искать (например, shell ('dir C:\\* file_name/s', intern = TRUE) - \\, чтобы избежать escape-символа). Будет работать только для файлов с уникальным именем, если вы не укажете дополнительные подкаталоги (для Linux я начал искать с /). В любом случае, если вы знаете, как найти что-то в оболочке, это обеспечивает макет, чтобы найти его внутри R и вернуть каталог. Если вы работаете или используете script, но я не полностью изучил потенциальные ошибки.

#Get operating system
OS<-Sys.info()
win<-length(grep("Windows",OS))
lin<-length(grep("Linux",OS))

#Find path of data directory
#Linux Bash Commands
if(lin==1){
  file_path<-system("find / -name 'file_name'", intern = TRUE)
  data_directory<-gsub('/file_name',"",file_path)
}
#Windows Command Prompt Commands
if(win==1){
  file_path<-shell('dir file_name /s', intern = TRUE)
  file_path<-file_path[4]
  file_path<-gsub(" Directory of ","",file_path)
  filepath<-gsub("\\\\","/",file_path)
  data_directory<-file_path
}

#Change working directory to location of data and sources  
setwd(data_directory)

Ответ 9

Спасибо за функцию, хотя мне пришлось немного отрегулировать ее следующим образом (W10):

#Windows Command Prompt Commands
if(win==1){
  file_path<-shell('dir file_name', intern = TRUE)
  file_path<-file_path[4]
  file_path<-gsub(" Verzeichnis von ","",file_path)
  file_path<-chartr("\\","/",file_path)
  data_directory<-file_path
}