Я использую эту функцию для быстрого и легкого sparklines с R, но я не могу понять, как изменить размер шрифта, чтобы избежать уродливых перекрытий меток ярлыков оси y. Здесь мой код (см. Ниже для воспроизводимого примера):
sparklines(gamma.df, sub=c(1:23),outer.margin = unit(c(2, 2, 2, 2), "cm"))
и полученный результат:
Кажется, я могу полностью подавить ось y с помощью
sparklines(gamma.df, sub=c(1:23),yaxis=FALSE,outer.margin = unit(c(2, 2, 2, 2), "cm"))
Но то, что я действительно хочу, просто сокращает числа на отметках (и добавляет серый шрифт под строку, но похоже, что мне придется рисовать полигоны на экране, что, вероятно, достаточно, чтобы заслужить отдельный вопрос... и другой пакет).
Документация предполагает, что gpar может иметь значение: "Во всех случаях, когда необходим список графических параметров, допустимые имена параметров такие же, как и при передаче в gpar в соответствующем вызове". Но мне нужна помощь, чтобы понять это, поскольку ни одна из моих попыток никуда не денется (то же самое для cex.axis и axis()). Любые эксперты по R grid графика там? Также приветствуются ссылки на хорошо документированный совершенно другой подход (ggplot2?), Который дает более качественный вывод в стиле искровой линии.
Вот некоторые примеры данных и кода, которые реплицируют мою проблему:
x <- data.frame(V = rnorm(1000), W = rnorm(1000), X = rnorm(1000), Y = rnorm(1000), Z = rnorm(10))
sparklines(x,outer.margin = unit(c(2, 2, 2, 2), "cm"))
И здесь приведенный примерный график данных с уродливыми перекрывающимися числами на отметках оси y:
UPDATE. Используя очень полезный plot код из @geek-on-acid и некоторый код с форума Tufte (см. ниже), я придумал альтернативный метод искры, который не работает 't используйте пакет YaleToolkit и выглядят хорошо... Здесь воспроизводимый пример (на самом деле всего две строки, но аннотированные здесь для моего образования):
x <- data.frame(V = rnorm(1000), W = rnorm(1000), X = rnorm(1000), Y = rnorm(1000),
Z = rnorm(1000)) # get a bit of data
par(mfrow=c(ncol(x),1), #sets number of rows in space to number of cols in data frame x
mar=c(1,0,0,0), #sets margin size for the figures
oma=c(4,5,4,4)) #sets outer margin
for (i in 1:ncol(x)){ # setup for statement to loops over all elements in a list or vector
plot(x[,i], #use col data, not rows from data frame x
col="grey",lwd=0.5, #make the line grey and thin
axes=F,ylab="",xlab="",main="",type="l"); #suppress axes lines, set as line plot
axis(2,yaxp=c(min(x[,i]),max(x[,i]),2), # y-axis: only show tickmarks for max and min values of col
cex.axis=1.1,las=1, # shrink fontsize slightly, make text horizontal for easy reading
at=c(round(min(x[,i]),3),round(max(x[,i]),3))); #specify where tickmark numbers go and round them to keep it tidy
axis(2,yaxp=c(min(x[,i]),max(x[,i]),2),col="white",tcl=0,labels=FALSE) #y-axis: put a 2nd white axis line over the 1st y-axis to make it invisible
ymin<-min(x[,i]); tmin<-which.min(x[,i]);ymax<-max(x[,i]);tmax<-which.max(x[,i]); # see the code from Jason below for what these do
points(x=c(tmin,tmax),y=c(ymin,ymax),pch=19,col=c("red","blue"),cex=1) # add coloured points at max and min
}
axis(1,pos=c(-5)) # places horizontal axis at the bottom of it all.
Вот результирующее изображение, которое в основном является решением моей проблемы. Маркеры меток оси Y стараются быть элегантными, показывая только максимальные и минимальные значения данных и не имеющие вертикальной линии. Еще раз спасибо @geek-on-acid за подсказку о том, как я могу получить одну ось x в нижней части их всех.
Наконец, для полноты я включаю некоторый код для световых линий, ближе к Tufte style от Джейсона Дитерле, который я нашел на Форум Tufte. Они выглядят намного лучше, чем мои, но код только делает один заговор за раз. Здесь оригинальное сообщение:
#Here is a simple R implementation of sparklines. Running sparkline() will generate a random sparkline; running sparkline(yourdata) will generate a sparkline using the data in yourdata. As an example, here is Google stock price for the last year.
#R sparklines
sparkline<-function(ydata=rnorm(100,500,50),width=1.5,height=0.5,sigfigs=4) {
# ydata = vector of data to be plotted
# width = width of sparlkline in inches, including text
# height = height of sparkline in inches
# sigfigs = number of significant figures to round min, max, and last values to
temppar<-par(no.readonly = TRUE) # store default graphics parameters
par(mai=c(0.10,0.05,0.10,0.05),fin=c(width,height)) # adjust graphics parameters for sparklines
len<-length(ydata) # determine the length of the data set
ymin<-min(ydata) # determine the minimum
tmin<-which.min(ydata) # and its index
ymax<-max(ydata) # determine the maximum
tmax<-which.max(ydata) # and its index
yfin<-signif(ydata[len],sigfigs) #determine most recent data point
plotrange=c(ymin-0.3*(ymax-ymin),ymax+0.3*(ymax-ymin)) # define plot range to leave enough room for min and max circles and text
plot(x=1:len,y=ydata,type="l",xlim=c(1,len*1.5),ylim=plotrange,col="gray",lwd=0.5,ann=FALSE,axes=FALSE) # plot sparkline
points(x=c(tmin,tmax),y=c(ymin,ymax),pch=19,col=c("red","blue"),cex=0.5) # plot min and max points
text(x=len,y=ymin,labels=signif(ymin,sigfigs),cex=0.5,pos=4,col="red") # show minimum value
text(x=len,y=ymax,labels=signif(ymax,sigfigs),cex=0.5,pos=4,col="blue") # show maximum value
text(x=len,y=(ymin+ymax)/2,labels=yfin,cex=0.5,pos=4) # show most recent value
par(temppar) # restore graphics defaults
}
#-- Jason Dieterle (email), January 28, 2008
и вот, что его результат выглядит (немного увеличен):
В дополнение к пакету YaleToolkit существует пакет sparkTable, о котором я узнал в stats.stackexchange, но не пробовали. В R-forge есть запись для другого пакета для создания искровых линий, но эта, похоже, неактивна или полезна.
