Автоматическое обновление пакетов, установленных из R-forge

Недавно я установил R-2.12.0 из R-2.11.1, и я обновил все пакеты CRAN с помощью:

update.packages(checkBuilt=TRUE, ask=FALSE)

Теперь я хочу обновить все пакеты, которые я установил из R-forge, но только если они недоступны в CRAN. Другими словами, я не могу просто запустить:

update.packages(checkBuilt=TRUE, ask=FALSE, repos="http://r-forge.r-project.org")

потому что он установил версию R-forge пакета survival по версии, поставляемой с R-2.12.0.

Возможно, я мог бы использовать некоторую комбинацию информации из old.packages и packageStatus, чтобы определить, какие пакеты существуют только в R-forge, но я хотел спросить, есть ли более простой способ до создания пользовательского решения.

# 1. Get the list of packages you have installed, # use priority to exclude base and recommended packages. # that may have been distributed with R. pkgList <- installed.packages(priority='NA')[,'Package'] # 2. Find out which packages are on CRAN and R-Forge. Because # of R-Forge build capacity is currently limiting the number of # binaries available, it is queried for source packages only. CRANpkgs <- available.packages( contriburl=contrib.url('http://cran.r-project.org'))[,'Package'] forgePkgs <- available.packages( contriburl=contrib.url('http://r-forge.r-project.org', type='source') )[,'Package'] # 3. Calculate the set of packages which are installed on your machine, # not on CRAN but also present on R-Force. pkgsToUp <- intersect(setdiff(pkgList, CRANpkgs), forgePkgs) # 4. Update the packages, using oldPkgs to restrict the list considered. update.packages(checkBuilt=TRUE, ask=FALSE, repos="http://r-forge.r-project.org", oldPkgs=pkgsToUp) # 5. Profit?

Ответ 1