Itertools.islice по сравнению со списком

Я пытаюсь применить алгоритм для сокращения списка python до меньшего, основанного на определенных критериях. Из-за большого объема исходного списка в порядке 100 тыс. Элементов я попытался использовать itertools для избежания множественных распределений памяти, поэтому я придумал следующее:

reducedVec = [ 'F' if sum( 1 for x in islice(vec, i, i+ratio) if x == 'F' ) 
                         > ratio / 3.0 else 'T'
                for i in xrange(0, len(vec), ratio) ]

Время выполнения для этого занимает довольно долгое время в порядке нескольких минут, когда vec имеет около 100 тыс. элементов. Когда я попытался вместо этого:

reducedVec = [ 'F' if sum( 1 for x in vec[i:i+ratio] if x == 'F' ) 
                         > ratio / 3.0 else 'T'
                for i in xrange(0, len(vec), ratio) ]

по сути, замените islice на срез, выполнение выполняется мгновенно.

Можете ли вы представить себе правдоподобное объяснение этому? Я бы подумал, что избегать многократного выделения нового списка с большим количеством элементов, на самом деле спасет мне несколько вычислительных циклов, а не калечит все выполнение.

Cheers, Фемида

ОТВЕТЫ

Ответ 1

islice работает с произвольными итерами. Чтобы сделать это, вместо того, чтобы прыгать прямо на n-й элемент, он должен перебирать первый n-1, отбрасывая их, а затем давать те, которые вы хотите.

Ознакомьтесь с чистой реализацией Python из документации itertools:

def islice(iterable, *args):
    # islice('ABCDEFG', 2) --> A B
    # islice('ABCDEFG', 2, 4) --> C D
    # islice('ABCDEFG', 2, None) --> C D E F G
    # islice('ABCDEFG', 0, None, 2) --> A C E G
    s = slice(*args)
    it = iter(xrange(s.start or 0, s.stop or sys.maxint, s.step or 1))
    nexti = next(it)
    for i, element in enumerate(iterable):
        if i == nexti:
            yield element
            nexti = next(it)

Говоря о документации itertools, если бы я пытался выполнить эту операцию, я бы, вероятно, использовал рецепт grouper. Это на самом деле не спасет вас от какой-либо памяти, но может быть, если вы переработаете ее, чтобы быть более ленивым, что было бы непросто.

from __future__ import division

from itertools import izip_longest
def grouper(n, iterable, fillvalue=None):
    "grouper(3, 'ABCDEFG', 'x') --> ABC DEF Gxx"
    args = [iter(iterable)] * n
    return izip_longest(fillvalue=fillvalue, *args)

reducedVec = []
for chunk in grouper(ratio, vec):
    if sum(1 for x in chunk if x == 'F') > ratio / 3:
        reducedVec.append('F')
    else:
        reducedVec.append('T')

Мне нравится использовать grouper, чтобы отвлечь последовательные фрагменты и найти этот код намного проще для чтения, чем оригинал

Ответ 2

Мое предположение заключалось бы в том, что использование islice() включает в себя вызов функции Python для каждого элемента vec, в то время как обозначение расширенного среза понимается парсером и транслируется непосредственно на вызовы CPython.