file.contain.query.txt
ENST001
ENST002
ENST003
file.to.search.in.txt
ENST001 90
ENST002 80
ENST004 50
Поскольку ENST003 не имеет записи во втором файле, а ENST004 не имеет записи в 1-м файле, ожидаемый результат:
ENST001 90
ENST002 80
Чтобы выполнить grep-запрос в конкретном файле, мы обычно делаем следующее:
grep -f file.contain.query <file.to.search.in >output.file
так как у меня есть 10000 запросов и почти 100000 raw в файле .to.search.in, это занимает очень много времени (например, 5 часов). Есть ли быстрая альтернатива grep -f?