Каков самый быстрый способ написать матрицу в текстовый файл в Octave?

Ответ 1

Следующее относится к MATLAB, но я предлагаю вам попробовать его в Octave. Прежде всего, если вы можете - транспонировать матрицу. Вот примеры с использованием fprintf и csvwrite (по существу dlmwrite)

A = rand(3, 1e6);
tic;
fid = fopen('data.txt', 'w+');
for i=1:size(A, 1)
    fprintf(fid, '%f ', A(i,:));
    fprintf(fid, '\n');
end
fclose(fid);
toc

tic;
csvwrite('data.txt', A);
toc;

Elapsed time is 1.311512 seconds.
Elapsed time is 2.487737 seconds.

Если он не транспонирован, это займет много времени. По умолчанию fprintf очищает буфер после каждого вызова. Вы можете попытаться использовать W вместо W, чтобы открыть файл, но это не улучшает ситуацию здесь слишком много.

Ответ 2

Вы попробовали это? Я не уверен в скорости по сравнению с dlmwrite.

a = [1 2;3 4];
save temp.txt a;

Ответ 3

Имея переменную data, вы можете сохранить ее в формате text с разделительными значениями пространства (включая заголовок):

save out.txt data

Заголовок можно просто удалить с помощью базовой команды Unix tail, например. (на любой Linux/Mac OS):

tail -n +6 out.txt > file.csv

Ответ 4

Теоретически, согласно тому, что говорит @angainor, можно даже повысить производительность обертывание как-то

for i=1:size(A, 1)
   fprintf(fid, '%f ', A(i,:));
   fprintf(fid, '\n');
end

в кусках, чтобы избежать бесполезной промывки буфера, т.е.

1. coverting (in memory) numbers->string + introduction of termination characters '\n' 
   (for say K matrix rows)
2. writing of the obtained string to file through fscanf.

Надо попробовать..

Ответ 5

Используйте это в Matlab:

 save -ascii output.txt variableName

Используйте это в Octave:

 save hello1.m variableName -ascii 

Ответ 6

В моей системе

A = rand(3, 1e6);

# Method with fprintf
tic;
fid = fopen('data1.txt', 'w+');
for i=1:size(A, 1)
    fprintf(fid, '%f ', A(i,:));
    fprintf(fid, '\n');
end
fclose(fid);
toc

# Method with sprintf
tic;
s = "";
for i=1:size(A, 1)
    s = strcat( s, sprintf('%f ', A(i,:)) );
    s = strcat( s, sprintf('\n') );
end
fid = fopen('data2.txt', 'w+');
    fprintf(fid, '%s\n', s);
fclose(fid);
toc

# Method with save
tic;
save 'data3.txt' A;
toc;

return;  # Commented when the size is <= 1e5

# Method with csvwrite
tic;
csvwrite('data4.txt', A);
toc;

дает

>> Elapsed time is 5.36293 seconds.
Elapsed time is 6.43252 seconds.
Elapsed time is 6.09889 seconds.

Поскольку csvwrite примерно в 10 раз медленнее других, я пробовал его только с размером = 10 ^ -5. В этом случае

>> Elapsed time is 0.541885 seconds.
Elapsed time is 0.657595 seconds.
Elapsed time is 0.576796 seconds.
Elapsed time is 4.24433 seconds.

Мои выводы:

1. Сравнение в скорости среди различных методов сильно зависит от системы. Тогда вам придется попробовать себя.

2. предложение Acorbe не соответствует его ожиданиям.