Проблемы с pip install numpy - RuntimeError: Broken toolchain: невозможно связать простую программу C

Я пытаюсь установить numpy (и scipy и matplotlib) в virturalenv.

Я все равно получаю эти ошибки:

RuntimeError: Broken toolchain: cannot link a simple C program

----------------------------------------
Cleaning up...
Command python setup.py egg_info failed with error code 1

У меня есть инструменты командной строки для установленного xcode

$ which gcc
/usr/bin/gcc
$ which cc
/usr/bin/cc

Я на Mac OSX 10.9 Использование brew установленного python

Edit
Да, пытаясь установить с помощью pip.
Весь трассировка огромна ( > 400 строк)

Вот его часть:

C compiler: cc -fno-strict-aliasing -fno-common -dynamic -arch x86_64 -arch i386 -g -Os -pipe -fno-common -fno-strict-aliasing -fwrapv -mno-fused-madd -DENABLE_DTRACE -DMACOSX -DNDEBUG -Wall -Wstrict-prototypes -Wshorten-64-to-32 -DNDEBUG -g -fwrapv -Os -Wall -Wstrict-prototypes -DENABLE_DTRACE -arch x86_64 -arch i386 -pipe



compile options: '-Inumpy/core/src/private -Inumpy/core/src -Inumpy/core -Inumpy/core/src/npymath -Inumpy/core/src/multiarray -Inumpy/core/src/umath -Inumpy/core/src/npysort -Inumpy/core/include -I/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/include/python2.7 -c'

cc: _configtest.c

clang: error: unknown argument: '-mno-fused-madd' [-Wunused-command-line-argument-hard-error-in-future]

clang: note: this will be a hard error (cannot be downgraded to a warning) in the future

clang: error: unknown argument: '-mno-fused-madd' [-Wunused-command-line-argument-hard-error-in-future]

clang: note: this will be a hard error (cannot be downgraded to a warning) in the future

failure.

removing: _configtest.c _configtest.o

Traceback (most recent call last):

  File "<string>", line 17, in <module>

  File "/Users/bdhammel/Documents/research_programming/julia_env/build/numpy/setup.py", line 192, in <module>

    setup_package()

  File "/Users/bdhammel/Documents/research_programming/julia_env/build/numpy/setup.py", line 185, in setup_package

    configuration=configuration )

  File "/Users/bdhammel/Documents/research_programming/julia_env/build/numpy/numpy/distutils/core.py", line 169, in setup

    return old_setup(**new_attr)

  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/core.py", line 152, in setup

    dist.run_commands()

  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/dist.py", line 953, in run_commands

    self.run_command(cmd)

  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/dist.py", line 972, in run_command

    cmd_obj.run()

  File "/Users/bdhammel/Documents/research_programming/julia_env/build/numpy/numpy/distutils/command/egg_info.py", line 10, in run

    self.run_command("build_src")

  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/cmd.py", line 326, in run_command

    self.distribution.run_command(command)

  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/dist.py", line 972, in run_command

    cmd_obj.run()

  File "/Users/bdhammel/Documents/research_programming/julia_env/build/numpy/numpy/distutils/command/build_src.py", line 153, in run

    self.build_sources()

  File "/Users/bdhammel/Documents/research_programming/julia_env/build/numpy/numpy/distutils/command/build_src.py", line 164, in build_sources

    self.build_library_sources(*libname_info)

  File "/Users/bdhammel/Documents/research_programming/julia_env/build/numpy/numpy/distutils/command/build_src.py", line 299, in build_library_sources

    sources = self.generate_sources(sources, (lib_name, build_info))

  File "/Users/bdhammel/Documents/research_programming/julia_env/build/numpy/numpy/distutils/command/build_src.py", line 386, in generate_sources

    source = func(extension, build_dir)

  File "numpy/core/setup.py", line 674, in get_mathlib_info

    raise RuntimeError("Broken toolchain: cannot link a simple C program")

RuntimeError: Broken toolchain: cannot link a simple C program

Ответ 1

В то время как он уродливый, он работает

sudo ARCHFLAGS=-Wno-error=unused-command-line-argument-hard-error-in-future pip install --upgrade numpy

Обратите внимание, что если вы получаете эту ошибку для пакета, отличного от numpy (например, lxml), укажите это имя пакета вместо numpy в конце комм.

Я видел аналогичную проблему, с которой кто-то сталкивался с установкой драгоценного камня

Установка Ruby Gem Json не работает на Mavericks и Xcode 5.1 - неизвестный аргумент: '-multiply_definedsuppress'

Это только временное исправление, в какой-то момент параметры компилятора должны быть исправлены.

Ответ 2

Для Docker (Alpine) и Python 3.x это сработало для меня:

RUN apk update
RUN apk add make automake gcc g++ subversion python3-dev

Ответ 3

Проблема в том, что вы не можете скомпилировать.

Во-первых, убедитесь, что вы приняли новые Условия и положения с помощью Xcode. Для этого просто откройте xCode и примите.

Затем попробуйте установить gcc с помощью

brew install gcc

Наконец, попробуйте установить Numpy с помощью

pip install numpy

Надеюсь, это поможет.

Ответ 4

Если вы не хотите использовать sudo (так что разрешения и подобные вещи сохраняются при использовании venv), вы можете добавить объявление ARCHFLAGS в свой .bash_profile и работать как обычно. Это сработало для меня с Mavericks и Xcode 5.1 с помощью venv:

В ~/.bash_profile:

export ARCHFLAGS = -Wno-error = unused-command-line-argument-hard-error-in-future

Затем просто запустите команду:

pip install --upgrade numpy

Ответ 5

Мне просто пришлось открыть XCode и принять соглашение и позволить ему устанавливать инструменты. Затем я вернулся к PyCharm и снова установил numpy без проблем.

Ответ 6

Для пользователей Fedora, имеющих аналогичную проблему, попробуйте установить эти пакеты:

(если не использовать python3, используйте python-devel и pip вместо pip3)

sudo dnf install python3-devel
sudo dnf install make automake gcc gcc-c++ gcc-gfortran
sudo dnf install redhat-rpm-config
sudo dnf install subversion

затем попробуйте

sudo pip3 install numpy

Ответ 7

Если вы используете дистрибутив Linux, вам может понадобиться компилятор C, особенно если вы видите контрольные строки журнала, такие как sh: gcc: command not found. Вы можете следовать инструкциям здесь, которые я кратко изложил ниже:

  • Fedora, Red Hat, CentOS или Scientific Linux

    # yum groupinstall 'Development Tools'

  • Debian или Ubuntu Linux

    $ sudo apt-get update $ sudo apt-get install build-essential manpages-dev

Затем вы можете попробовать повторить:

sudo pip install numpy

Ответ 8

В некоторых случаях после того, как OS X обновит XCode, XCode потребует от пользователя (с правами администратора) принять новую лицензию. Пока лицензия не будет принята, clang и gcc выдадут ошибку при попытке скомпилировать и связать код. Или, по крайней мере, пакеты python.

Если вы запустите XCode и примите лицензию, ошибки больше не появятся.

По крайней мере, это было для меня.

Ответ 9

Выше работала для меня только после установки python3-dev.

Ответ 10

Это означает, что он не может найти ваш компилятор C. Попробуйте установить компилятор gcc, если сбой другого компилятора не работает.

Ответ 11

В Fedora 22 это было разрешено путем обновления самого пакета: sudo pip install --upgrade pip