Итерирование по массиву numpy

Существует ли менее верная альтернатива этому:

for x in xrange(array.shape[0]):
    for y in xrange(array.shape[1]):
        do_stuff(x, y)

Я придумал это:

for x, y in itertools.product(map(xrange, array.shape)):
    do_stuff(x, y)

Что сохраняет одно отступ, но все еще довольно уродливо.

Я надеюсь на что-то похожее на этот псевдокод:

for x, y in array.indices:
    do_stuff(x, y)

Есть ли что-нибудь подобное?

Ответ 1

Я думаю, что вы ищете ndenumerate.

>>> a =numpy.array([[1,2],[3,4],[5,6]])
>>> for (x,y), value in numpy.ndenumerate(a):
...  print x,y
... 
0 0
0 1
1 0
1 1
2 0
2 1

Относительно производительности. Это немного медленнее, чем понимание списка.

X = np.zeros((100, 100, 100))

%timeit list([((i,j,k), X[i,j,k]) for i in range(X.shape[0]) for j in range(X.shape[1]) for k in range(X.shape[2])])
1 loop, best of 3: 376 ms per loop

%timeit list(np.ndenumerate(X))
1 loop, best of 3: 570 ms per loop

Если вас беспокоит производительность, вы можете немного оптимизировать ее, посмотрев на реализацию ndenumerate, которая делает 2 вещи, конвертируя в массив и зацикливая. Если вы знаете, что у вас есть массив, вы можете вызвать атрибут .coords плоского итератора.

a = X.flat
%timeit list([(a.coords, x) for x in a.flat])
1 loop, best of 3: 305 ms per loop

Ответ 2

Если вам нужны только индексы, вы можете попробовать numpy.ndindex:

>>> a = numpy.arange(9).reshape(3, 3)
>>> [(x, y) for x, y in numpy.ndindex(a.shape)]
[(0, 0), (0, 1), (0, 2), (1, 0), (1, 1), (1, 2), (2, 0), (2, 1), (2, 2)]

Ответ 3

см. nditer

import numpy as np
Y = np.array([3,4,5,6])
for y in np.nditer(Y, op_flags=['readwrite']):
    y += 3

Y == np.array([6, 7, 8, 9])

y = 3 не будет работать, вместо этого используйте y *= 0 и y += 3.