PyInstaller: модуль не включен в -onefile, но отлично работает с --oneir

Я использую PyInstaller для объединения моего приложения в один файл .exe. Проблема в том, что он отлично работает с опцией --oneir, но не может найти модуль при построении с -onefile.

Оба --oneir и -onefile говорят во время процесса сборки:

<...>
INFO: Analyzing hidden import 'sklearn.utils.sparsetools._graph_validation'
<...>

Запуск экземпляра, созданного с помощью --oneir, отлично работает, но экземпляр, созданный --onefile, умирает:

<...>
  File "_min_spanning_tree.pyx", line 8, in init sklearn.utils.mst._min_spanning
_tree (sklearn\utils\sparsetools\_min_spanning_tree.c:4754)
ImportError: No module named _graph_validation

Вот мои файлы .spec

onedir.spec

# -*- mode: python -*-
a = Analysis(['../../brainactivity.py'],
             hiddenimports=['greenlet', 'sklearn.utils.sparsetools._graph_validation', 'sklearn.utils.sparsetools._graph_tools', 'scipy.special._ufuncs_cxx', 'sklearn.utils.lgamma', 'sklearn.utils.weight_vector'],
             hookspath=None,
             runtime_hooks=None)
pyz = PYZ(a.pure)
exe = EXE(pyz,
          a.scripts,
          exclude_binaries=True,
          name='brainactivity.exe',
          debug=False,
          strip=None,
          upx=True,
          console=True,)
coll = COLLECT(exe,
               a.binaries,
               [('./data/201305182224-DF-facial-3-420.csv', '../../data/201305182224-DF-facial-3-420.csv', 'DATA')],
               [('./model/brain_20k_colored_properly.obj', '../../model/brain_20k_colored_properly.obj', 'DATA')],
               [('brain_fragment_shader.glsl', '../../brain_fragment_shader.glsl', 'DATA')],
               [('brain_vertex_shader.glsl', '../../brain_vertex_shader.glsl', 'DATA')],
               a.zipfiles,
               a.datas,
               strip=None,
               upx=True,
               name='brainactivity')

onefile.spec

# -*- mode: python -*-
a = Analysis(['../../brainactivity.py'],
             hiddenimports=['greenlet', 'sklearn.utils.sparsetools._graph_validation', 'sklearn.utils.sparsetools._graph_tools', 'scipy.special._ufuncs_cxx', 'sklearn.utils.lgamma', 'sklearn.utils.weight_vector'],
             hookspath='.',
             runtime_hooks=None)
pyz = PYZ(a.pure)
exe = EXE(pyz,
          a.scripts,
          a.binaries,
          [('./data/201305182224-DF-facial-3-420.csv', '../../data/201305182224-DF-facial-3-420.csv', 'DATA')],
          [('./model/brain_20k_colored_properly.obj', '../../model/brain_20k_colored_properly.obj', 'DATA')],
          [('brain_fragment_shader.glsl', '../../brain_fragment_shader.glsl', 'DATA')],
          [('brain_vertex_shader.glsl', '../../brain_vertex_shader.glsl', 'DATA')],
          a.zipfiles,
          a.datas,
          name='brainactivity.exe',
          debug=False,
          strip=None,
          upx=True,
          console=True )

ОТВЕТЫ

Ответ 1

У меня была такая же ошибка. Решение состоит в том, чтобы создать крючок для sklearn. Как правило, вам нужно создать файл с крючком, подобный этому

hiddenimports = ['sklearn.utils.sparsetools._graph_validation']

и сохраните это в файле с именем hook-modulename.py в той же папке. Но это будет импортировать только _graph_validation. Это может привести к ошибке для другого модуля. Лучше всего импортировать все подмодули в пакете

from hookutils import collect_submodules
hiddenimports = collect_submodules('sklearn')

и сохраните его в файле с крючками в той же папке. Для меня мне пришлось создать 2 файла с крючками. один для sklearn и один для scipy.

from hookutils import collect_submodules
hiddenimports = collect_submodules('scipy')

после их сохранения я использовал команду ниже для запуска

pyinstaller --additional-hooks-dir =. myfile.py

для лучшего понимания следуйте http://pythonhosted.org/PyInstaller/hooks.html#understanding-pyinstaller-hooks

Ответ 2

просто импортируйте следующие пакеты в скрипт, который будет конвертирован в исполняемый файл

 import xgboost
 import sklearn.ensemble
 import sklearn.tree
 import pickle
 import pandas as pd
 import sklearn.neighbors.typedefs
 import sklearn.neighbors.quad_tree
 import sklearn.tree._utils
 import cython
 import sklearn
 import sklearn.utils._cython_blas
 import numpy as np
 import joblib
 from sklearn.preprocessing import StandardScaler

это поможет мне в решении этой проблемы.