Похоже, есть ограничение на количество отображаемых строк.
Я не смог найти его в настройках.
Есть ли способ заставить IDEA хранить все в окне вывода?
Ответ 1
Preferences/Settings → Editor → General → Console, установите флажок Override console cycle buffer size, установите большее значение, чем 1024 КБ.
Ответ 2
Не удалось получить больше голосов, чтобы закрыть вопрос, поэтому я должен сам ответить на него.
IDEA_HOME\Bin\idea.properties
#-----------------------------------------------------------------------
# This option controls console cyclic buffer: keeps the console output size not higher than the specified buffer size (Kb). Older lines are deleted.
# In order to disable cycle buffer use idea.cycle.buffer.size=disabled
idea.cycle.buffer.size=1024