Я очень новичок в Python. Я знаю, что это уже было задано, и я извиняюсь, но разница в этой новой ситуации заключается в том, что пробелы между строками не равны. У меня есть файл с именем coord, который содержит следующие строки с разделителями пробелов:
1 C 6.00 0.000000000 1.342650315 0.000000000
2 C 6.00 0.000000000 -1.342650315 0.000000000
3 C 6.00 2.325538562 2.685300630 0.000000000
4 C 6.00 2.325538562 -2.685300630 0.000000000
5 C 6.00 4.651077125 1.342650315 0.000000000
6 C 6.00 4.651077125 -1.342650315 0.000000000
7 C 6.00 -2.325538562 2.685300630 0.000000000
8 C 6.00 -2.325538562 -2.685300630 0.000000000
9 C 6.00 -4.651077125 1.342650315 0.000000000
10 C 6.00 -4.651077125 -1.342650315 0.000000000
11 H 1.00 2.325538562 4.733763602 0.000000000
12 H 1.00 2.325538562 -4.733763602 0.000000000
13 H 1.00 -2.325538562 4.733763602 0.000000000
14 H 1.00 -2.325538562 -4.733763602 0.000000000
15 H 1.00 6.425098097 2.366881801 0.000000000
16 H 1.00 6.425098097 -2.366881801 0.000000000
17 H 1.00 -6.425098097 2.366881801 0.000000000
18 H 1.00 -6.425098097 -2.366881801 0.000000000
Пожалуйста, обратите внимание на пробелы перед началом каждой строки в первом столбце. Поэтому я попытался сделать следующее, чтобы преобразовать его в csv:
with open('coord') as infile, open('coordv', 'w') as outfile:
outfile.write(infile.read().replace(" ", ", "))
# Unneeded columns are deleted from the csv
input = open('coordv', 'rb')
output = open('coordcsvout', 'wb')
writer = csv.writer(output)
for row in csv.reader(input):
if row:
writer.writerow(row)
input.close()
output.close()
with open("coordcsvout","rb") as source:
rdr= csv.reader( source )
with open("coordbarray","wb") as result:
wtr= csv.writer(result)
for r in rdr:
wtr.writerow( (r[5], r[6], r[7]) )
Когда я запускаю script, я получаю следующее для coordv в самой первой части script, что, конечно, очень неправильно:
, 1, C, , , 6.00, , 0.000000000, , 1.342650315, , 0.000000000
, 2, C, , , 6.00, , 0.000000000, -1.342650315, , 0.000000000
, 3, C, , , 6.00, , 2.325538562, , 2.685300630, , 0.000000000
, 4, C, , , 6.00, , 2.325538562, -2.685300630, , 0.000000000
, 5, C, , , 6.00, , 4.651077125, , 1.342650315, , 0.000000000
, 6, C, , , 6.00, , 4.651077125, -1.342650315, , 0.000000000
, 7, C, , , 6.00, -2.325538562, , 2.685300630, , 0.000000000
, 8, C, , , 6.00, -2.325538562, -2.685300630, , 0.000000000
, 9, C, , , 6.00, -4.651077125, , 1.342650315, , 0.000000000
, 10, C, , , 6.00, -4.651077125, -1.342650315, , 0.000000000
, 11, H, , , 1.00, , 2.325538562, , 4.733763602, , 0.000000000
, 12, H, , , 1.00, , 2.325538562, -4.733763602, , 0.000000000
, 13, H, , , 1.00, -2.325538562, , 4.733763602, , 0.000000000
, 14, H, , , 1.00, -2.325538562, -4.733763602, , 0.000000000
, 15, H, , , 1.00, , 6.425098097, , 2.366881801, , 0.000000000
, 16, H, , , 1.00, , 6.425098097, -2.366881801, , 0.000000000
, 17, H, , , 1.00, -6.425098097, , 2.366881801, , 0.000000000
, 18, H, , , 1.00, -6.425098097, -2.366881801, , 0.000000000
Я пробовал разные возможности в .replace без каких-либо успехов, и до сих пор я не нашел никакого источника информации о том, как я мог это сделать. Каким будет лучший способ получить значения, разделенные запятыми, из этого файла cop? Меня интересует использование модуля csv в python для выбора столбцов 4: 6 и, наконец, использование numpy для их импорта следующим образом:
from numpy import genfromtxt
cocmatrix = genfromtxt('input', delimiter=',')
Я был бы очень рад, если бы кто-нибудь помог мне с этой проблемой.