Ищете регулярную регулярную последовательность совпадений и заменяет (желательно PHP, но не имеет значения), чтобы изменить это (начало и конец - это просто случайный текст, который необходимо сохранить).
В:
fkdshfks khh fdsfsk
<!--g1-->
<div class='codetop'>CODE: AutoIt</div>
<div class='geshimain'>
<!--eg1-->
<div class="autoit" style="font-family:monospace;">
<span class="kw3">msgbox</span>
</div>
<!--gc2-->
<!--bXNnYm94-->
<!--egc2-->
<!--g2-->
</div>
<!--eg2-->
fdsfdskh
к этому OUT:
fkdshfks khh fdsfsk
<div class='codetop'>CODE: AutoIt</div>
<div class='geshimain'>
<div class="autoit" style="font-family:monospace;">
<span class="kw3">msgbox</span>
</div>
</div>
fdsfdskh
Спасибо.