Как сделать графику с прозрачным фоном в R, используя ggplot2?

Мне нужно вывести графику ggplot2 из файлов R в PNG с прозрачным фоном. Все в порядке с базовой графикой R, но без прозрачности с ggplot2:

d <- rnorm(100) #generating random data

#this returns transparent png
png('tr_tst1.png',width=300,height=300,units="px",bg = "transparent")
boxplot(d)
dev.off()

df <- data.frame(y=d,x=1)
p <- ggplot(df) + stat_boxplot(aes(x = x,y=y)) 
p <- p + opts(
    panel.background = theme_rect(fill = "transparent",colour = NA), # or theme_blank()
    panel.grid.minor = theme_blank(), 
    panel.grid.major = theme_blank()
)
#returns white background
png('tr_tst2.png',width=300,height=300,units="px",bg = "transparent")
p
dev.off()

Есть ли способ получить прозрачный фон с ggplot2?

Ответ 1

Обновлен функцией theme(), ggsave() и кодом для фона легенды:

df <- data.frame(y = d, x = 1, group = rep(c("gr1", "gr2"), 50))
p <- ggplot(df) +
  stat_boxplot(aes(x = x, y = y, color = group), 
               fill = "transparent" # for the inside of the boxplot
  ) 

Самый быстрый способ - использование rect, поскольку все элементы прямоугольника наследуются от прямоугольника:

p <- p +
  theme(
        rect = element_rect(fill = "transparent") # all rectangles
      )
    p

Более контролируемым способом является использование параметров theme:

p <- p +
  theme(
    panel.background = element_rect(fill = "transparent"), # bg of the panel
    plot.background = element_rect(fill = "transparent", color = NA), # bg of the plot
    panel.grid.major = element_blank(), # get rid of major grid
    panel.grid.minor = element_blank(), # get rid of minor grid
    legend.background = element_rect(fill = "transparent"), # get rid of legend bg
    legend.box.background = element_rect(fill = "transparent") # get rid of legend panel bg
  )
p

Чтобы сохранить (этот последний шаг важен):

ggsave(p, filename = "tr_tst2.png",  bg = "transparent")

Ответ 2

В дополнение к panel.background также есть опция plot.background:

df <- data.frame(y=d,x=1)
p <- ggplot(df) + stat_boxplot(aes(x = x,y=y)) 
p <- p + opts(
    panel.background = theme_rect(fill = "transparent",colour = NA), # or theme_blank()
    panel.grid.minor = theme_blank(), 
    panel.grid.major = theme_blank(),
    plot.background = theme_rect(fill = "transparent",colour = NA)
)
#returns white background
png('tr_tst2.png',width=300,height=300,units="px",bg = "transparent")
print(p)
dev.off()

По какой-то причине загруженное изображение отображается иначе, чем на моем компьютере, поэтому я опустил его. Но для меня я получаю сюжет с совершенно серым фоном, за исключением коробки в коробке, которая все еще белая. Я думаю, что это можно изменить, используя эстетику заливки в геометрии boxplot.

Edit

ggplot2 с тех пор обновлен и функция opts() устарела. В настоящее время вместо opts() и element_rect() вместо theme_rect() и т.д. Используйте theme() и т.д.

Ответ 3

Просто чтобы улучшить ответ YCR:

1) Я добавил черные линии на осях X и Y. В противном случае они тоже становятся прозрачными.

2) Я добавил прозрачную тему к ключу легенды. В противном случае вы получите заполнение, которое не будет очень эстетичным.

Наконец, обратите внимание, что все они работают только с форматами pdf и png. jpeg не может создать прозрачные графики.

MyTheme_transparent <- theme(
    panel.background = element_rect(fill = "transparent"), # bg of the panel
    plot.background = element_rect(fill = "transparent", color = NA), # bg of the plot
    panel.grid.major = element_blank(), # get rid of major grid
    panel.grid.minor = element_blank(), # get rid of minor grid
    legend.background = element_rect(fill = "transparent"), # get rid of legend bg
    legend.box.background = element_rect(fill = "transparent"), # get rid of legend panel bg
    legend.key = element_rect(fill = "transparent", colour = NA), # get rid of key legend fill, and of the surrounding
    axis.line = element_line(colour = "black") # adding a black line for x and y axis
)