Я вижу здесь:
http://www.pgrs.net/2008/1/11/command-line-clipboard-access
что есть способ в linux и osx копировать в буфер обмена из командной строки. Поэтому я запустил свой файл cygwin setup.exe, но не смог найти пакет xsel. Я предполагаю, что этот пакет не был перенесен в окна? Похоже, есть инструмент для этого в окнах:
http://www.labnol.org/software/tutorials/copy-dos-command-line-output-clipboard-clip-exe/2506/
Думаю, я попробую это, но в среднем я решил, что спрошу, нашел ли кто-нибудь хорошее решение.