Большинство ОС скроют "dot-files" / "системные файлы", если вы не заставите их стать видимыми.
Ответ 2
У меня был вопрос, похожий на вопрос 2 из OP, но он был специально сфокусирован на разнице между файлами .Rprofile и Rprofile.site.
Исходя из того, что я почерпнул, при ?Startup и некоторых других ответах на вопрос, вот мое понимание этой разницы:
Rprofile.site - это профиль запуска всего сайта - он ищется и запускается ДО .Rprofile и перезаписывает базовый пакет. .Rprofile - это профиль запуска пользователя, который ищет и получает ПОСЛЕ Rprofile.site и загружает содержимое в рабочую область, а не перезаписывает базовый пакет.
Я также нашел этот ответ полезным для понимания разницы.
Ответ 3
Я нашел эту статью полезной для ответа на второй вопрос OP: "В чем разница между Rprofile, Renviron и Rprofile.site, Renviron.site?" По сути, Rxxx.site содержит настройки, относящиеся к конкретному сайту (то есть текущему компьютеру), в то время как .Rxxx содержит project- или настройки, специфичные для пользователя.
Ответ 4
Вот также другая документация, связанная со вторым вопросом