Вывод разницы в двух фреймах Pandas бок о бок - выделение разницы

Я пытаюсь точно указать, что изменилось между двумя кадрами данных.

Предположим, что у меня есть два фрейма данных Pandas Python

:
"StudentRoster Jan-1":
id   Name   score                    isEnrolled           Comment
111  Jack   2.17                     True                 He was late to class
112  Nick   1.11                     False                Graduated
113  Zoe    4.12                     True       

"StudentRoster Jan-2":
id   Name   score                    isEnrolled           Comment
111  Jack   2.17                     True                 He was late to class
112  Nick   1.21                     False                Graduated
113  Zoe    4.12                     False                On vacation

Моя цель - вывести таблицу HTML, которая:

  • Идентифицирует строки, которые были изменены (может быть int, float, boolean, string)
  • Выводит строки с одинаковыми значениями OLD и NEW (в идеале в таблицу HTML), чтобы потребитель мог четко видеть, что изменилось между двумя кадрами данных:

    "StudentRoster Difference Jan-1 - Jan-2":  
    id   Name   score                    isEnrolled           Comment
    112  Nick   was 1.11| now 1.21       False                Graduated
    113  Zoe    4.12                     was True | now False was "" | now   "On   vacation"
    

Я полагаю, что я мог бы делать сравнение строк за строкой и столбцом по столбцам, но есть ли более простой способ?

Ответ 1

Первая часть похожа на Constantine, вы можете получить булев, строки которого пустые *:

In [21]: ne = (df1 != df2).any(1)

In [22]: ne
Out[22]:
0    False
1     True
2     True
dtype: bool

Затем мы видим, какие записи изменились:

In [23]: ne_stacked = (df1 != df2).stack()

In [24]: changed = ne_stacked[ne_stacked]

In [25]: changed.index.names = ['id', 'col']

In [26]: changed
Out[26]:
id  col
1   score         True
2   isEnrolled    True
    Comment       True
dtype: bool

Здесь первая запись - это индекс, а второй - столбцы, которые были изменены.

In [27]: difference_locations = np.where(df1 != df2)

In [28]: changed_from = df1.values[difference_locations]

In [29]: changed_to = df2.values[difference_locations]

In [30]: pd.DataFrame({'from': changed_from, 'to': changed_to}, index=changed.index)
Out[30]:
               from           to
id col
1  score       1.11         1.21
2  isEnrolled  True        False
   Comment     None  On vacation

* Примечание: важно, чтобы df1 и df2 использовали один и тот же индекс. Чтобы преодолеть эту двусмысленность, вы можете обеспечить просмотр только общих меток с помощью df1.index & df2.index, но я думаю, что я оставлю это как упражнение.

Ответ 2

Я столкнулся с этой проблемой, но нашел ответ, прежде чем найти этот пост:

На основе ответа unutbu загрузите свои данные...

import pandas as pd
import io

texts = ['''\
id   Name   score                    isEnrolled                       Date
111  Jack                            True              2013-05-01 12:00:00
112  Nick   1.11                     False             2013-05-12 15:05:23
     Zoe    4.12                     True                                  ''',

         '''\
id   Name   score                    isEnrolled                       Date
111  Jack   2.17                     True              2013-05-01 12:00:00
112  Nick   1.21                     False                                
     Zoe    4.12                     False             2013-05-01 12:00:00''']


df1 = pd.read_fwf(io.BytesIO(texts[0]), widths=[5,7,25,17,20], parse_dates=[4])
df2 = pd.read_fwf(io.BytesIO(texts[1]), widths=[5,7,25,17,20], parse_dates=[4])

... определить вашу функцию diff...

def report_diff(x):
    return x[0] if x[0] == x[1] else '{} | {}'.format(*x)

Затем вы можете просто использовать панель, чтобы заключить:

my_panel = pd.Panel(dict(df1=df1,df2=df2))
print my_panel.apply(report_diff, axis=0)

#          id  Name        score    isEnrolled                       Date
#0        111  Jack   nan | 2.17          True        2013-05-01 12:00:00
#1        112  Nick  1.11 | 1.21         False  2013-05-12 15:05:23 | NaT
#2  nan | nan   Zoe         4.12  True | False  NaT | 2013-05-01 12:00:00

Кстати, если вы находитесь в ноутбуке IPython, вам может понравиться использовать цветную функцию diff давать цвета в зависимости от того, являются ли ячейки разными, равными или левыми/правыми:

from IPython.display import HTML
pd.options.display.max_colwidth = 500  # You need this, otherwise pandas
#                          will limit your HTML strings to 50 characters

def report_diff(x):
    if x[0]==x[1]:
        return unicode(x[0].__str__())
    elif pd.isnull(x[0]) and pd.isnull(x[1]):
        return u'<table style="background-color:#00ff00;font-weight:bold;">'+\
            '<tr><td>%s</td></tr><tr><td>%s</td></tr></table>' % ('nan', 'nan')
    elif pd.isnull(x[0]) and ~pd.isnull(x[1]):
        return u'<table style="background-color:#ffff00;font-weight:bold;">'+\
            '<tr><td>%s</td></tr><tr><td>%s</td></tr></table>' % ('nan', x[1])
    elif ~pd.isnull(x[0]) and pd.isnull(x[1]):
        return u'<table style="background-color:#0000ff;font-weight:bold;">'+\
            '<tr><td>%s</td></tr><tr><td>%s</td></tr></table>' % (x[0],'nan')
    else:
        return u'<table style="background-color:#ff0000;font-weight:bold;">'+\
            '<tr><td>%s</td></tr><tr><td>%s</td></tr></table>' % (x[0], x[1])

HTML(my_panel.apply(report_diff, axis=0).to_html(escape=False))

Ответ 3

import pandas as pd
import io

texts = ['''\
id   Name   score                    isEnrolled                        Comment
111  Jack   2.17                     True                 He was late to class
112  Nick   1.11                     False                           Graduated
113  Zoe    4.12                     True       ''',

         '''\
id   Name   score                    isEnrolled                        Comment
111  Jack   2.17                     True                 He was late to class
112  Nick   1.21                     False                           Graduated
113  Zoe    4.12                     False                         On vacation''']


df1 = pd.read_fwf(io.BytesIO(texts[0]), widths=[5,7,25,21,20])
df2 = pd.read_fwf(io.BytesIO(texts[1]), widths=[5,7,25,21,20])
df = pd.concat([df1,df2]) 

print(df)
#     id  Name  score isEnrolled               Comment
# 0  111  Jack   2.17       True  He was late to class
# 1  112  Nick   1.11      False             Graduated
# 2  113   Zoe   4.12       True                   NaN
# 0  111  Jack   2.17       True  He was late to class
# 1  112  Nick   1.21      False             Graduated
# 2  113   Zoe   4.12      False           On vacation

df.set_index(['id', 'Name'], inplace=True)
print(df)
#           score isEnrolled               Comment
# id  Name                                        
# 111 Jack   2.17       True  He was late to class
# 112 Nick   1.11      False             Graduated
# 113 Zoe    4.12       True                   NaN
# 111 Jack   2.17       True  He was late to class
# 112 Nick   1.21      False             Graduated
# 113 Zoe    4.12      False           On vacation

def report_diff(x):
    return x[0] if x[0] == x[1] else '{} | {}'.format(*x)

changes = df.groupby(level=['id', 'Name']).agg(report_diff)
print(changes)

печатает

                score    isEnrolled               Comment
id  Name                                                 
111 Jack         2.17          True  He was late to class
112 Nick  1.11 | 1.21         False             Graduated
113 Zoe          4.12  True | False     nan | On vacation

Ответ 4

Этот ответ просто расширяет @Andy Hayden's, делая его устойчивым, когда числовые поля nan и завершают его в функцию.

import pandas as pd
import numpy as np


def diff_pd(df1, df2):
    """Identify differences between two pandas DataFrames"""
    assert (df1.columns == df2.columns).all(), \
        "DataFrame column names are different"
    if df1.equals(df2):
        return None
    else:
        # need to account for np.nan != np.nan returning True
        diff_mask = (df1 != df2) & ~(df1.isnull() & df2.isnull())
        ne_stacked = diff_mask.stack()
        changed = ne_stacked[ne_stacked]
        changed.index.names = ['id', 'col']
        difference_locations = np.where(diff_mask)
        changed_from = df1.values[difference_locations]
        changed_to = df2.values[difference_locations]
        return pd.DataFrame({'from': changed_from, 'to': changed_to},
                            index=changed.index)

Итак, ваши данные (слегка отредактированные, чтобы иметь NaN в столбце оценки):

import sys
if sys.version_info[0] < 3:
    from StringIO import StringIO
else:
    from io import StringIO

DF1 = StringIO("""id   Name   score                    isEnrolled           Comment
111  Jack   2.17                     True                 "He was late to class"
112  Nick   1.11                     False                "Graduated"
113  Zoe    NaN                     True                  " "
""")
DF2 = StringIO("""id   Name   score                    isEnrolled           Comment
111  Jack   2.17                     True                 "He was late to class"
112  Nick   1.21                     False                "Graduated"
113  Zoe    NaN                     False                "On vacation" """)
df1 = pd.read_table(DF1, sep='\s+', index_col='id')
df2 = pd.read_table(DF2, sep='\s+', index_col='id')
diff_pd(df1, df2)

Вывод:

                from           to
id  col                          
112 score       1.11         1.21
113 isEnrolled  True        False
    Comment           On vacation

Ответ 5

Подчеркивая разницу между двумя DataFrames

Можно использовать свойство стиля DataFrame, чтобы выделить цвет фона в ячейках, где есть разница.

Используя данные примера из исходного вопроса

Первый шаг - объединить DataFrames по горизонтали с помощью функции concat и выделить каждый кадр с параметром keys:

df_all = pd.concat([df.set_index('id'), df2.set_index('id')], 
                   axis='columns', keys=['First', 'Second'])
df_all

введите описание изображения здесь

Вероятно, проще заменить уровни столбцов и поместить одинаковые имена столбцов рядом друг с другом:

df_final = df_all.swaplevel(axis='columns')[df.columns[1:]]
df_final

введите описание изображения здесь

Теперь гораздо проще определить различия в кадрах. Но мы можем пойти дальше и использовать свойство style, чтобы выделить ячейки, которые отличаются. Мы определяем настраиваемую функцию, которую вы можете увидеть в этой части документации.

def highlight_diff(data, color='yellow'):
    attr = 'background-color: {}'.format(color)
    other = data.xs('First', axis='columns', level=-1)
    return pd.DataFrame(np.where(data.ne(other, level=0), attr, ''),
                        index=data.index, columns=data.columns)

df_final.style.apply(highlight_diff, axis=None)

введите описание изображения здесь

Это выделит ячейки, у которых есть отсутствующие значения. Вы можете заполнить их или предоставить дополнительную логику, чтобы они не выделялись.

Ответ 6

Если ваши два блока данных имеют одинаковые идентификаторы в них, то выяснение того, что изменилось, на самом деле довольно просто. Просто выполнение frame1 != frame2 даст вам логический DataFrame, где каждый True - это данные, которые были изменены. Из этого вы можете легко получить индекс каждой измененной строки, выполнив changedids = frame1.index[np.any(frame1 != frame2,axis=1)].

Ответ 7

Расширение ответа @cge, что довольно круто для большей удобочитаемости результата:

a[a != b][np.any(a != b, axis=1)].join(DataFrame('a<->b', index=a.index, columns=['a<=>b'])).join(
        b[a != b][np.any(a != b, axis=1)]
        ,rsuffix='_b', how='outer'
).fillna('')

Полный демонстрационный пример:

a = DataFrame(np.random.randn(7,3), columns=list('ABC'))
b = a.copy()
b.iloc[0,2] = np.nan
b.iloc[1,0] = 7
b.iloc[3,1] = 77
b.iloc[4,2] = 777

a[a != b][np.any(a != b, axis=1)].join(DataFrame('a<->b', index=a.index, columns=['a<=>b'])).join(
        b[a != b][np.any(a != b, axis=1)]
        ,rsuffix='_b', how='outer'
).fillna('')

Ответ 8

Другой подход с использованием concat и drop_duplicates:

import sys
if sys.version_info[0] < 3:
    from StringIO import StringIO
else:
    from io import StringIO
import pandas as pd

DF1 = StringIO("""id   Name   score                    isEnrolled           Comment
111  Jack   2.17                     True                 "He was late to class"
112  Nick   1.11                     False                "Graduated"
113  Zoe    NaN                     True                  " "
""")
DF2 = StringIO("""id   Name   score                    isEnrolled           Comment
111  Jack   2.17                     True                 "He was late to class"
112  Nick   1.21                     False                "Graduated"
113  Zoe    NaN                     False                "On vacation" """)

df1 = pd.read_table(DF1, sep='\s+', index_col='id')
df2 = pd.read_table(DF2, sep='\s+', index_col='id')
#%%
dictionary = {1:df1,2:df2}
df=pd.concat(dictionary)
df.drop_duplicates(keep=False)

Вывод:

       Name  score isEnrolled      Comment
  id                                      
1 112  Nick   1.11      False    Graduated
  113   Zoe    NaN       True             
2 112  Nick   1.21      False    Graduated
  113   Zoe    NaN      False  On vacation

Ответ 9

Вот еще один способ использования select и merge:

In [6]: # first lets create some dummy dataframes with some column(s) different
   ...: df1 = pd.DataFrame({'a': range(-5,0), 'b': range(10,15), 'c': range(20,25)})
   ...: df2 = pd.DataFrame({'a': range(-5,0), 'b': range(10,15), 'c': [20] + list(range(101,105))})


In [7]: df1
Out[7]:
   a   b   c
0 -5  10  20
1 -4  11  21
2 -3  12  22
3 -2  13  23
4 -1  14  24


In [8]: df2
Out[8]:
   a   b    c
0 -5  10   20
1 -4  11  101
2 -3  12  102
3 -2  13  103
4 -1  14  104


In [10]: # make condition over the columns you want to comapre
    ...: condition = df1['c'] != df2['c']
    ...:
    ...: # select rows from each dataframe where the condition holds
    ...: diff1 = df1[condition]
    ...: diff2 = df2[condition]


In [11]: # merge the selected rows (dataframes) with some suffixes (optional)
    ...: diff1.merge(diff2, on=['a','b'], suffixes=('_before', '_after'))
Out[11]:
   a   b  c_before  c_after
0 -4  11        21      101
1 -3  12        22      102
2 -2  13        23      103
3 -1  14        24      104

Вот то же самое из снимка Jupyter:

введите описание изображения здесь